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GhostBSDでは、3つの方法でソフトウェアをインストールできます:

  • GTK+をベースに動作し、BSDのバイナリーパッケージを管理(インストールやアンインストール、検索)できるOctoPkgがあります。
  • FreeBSDのパッケージマネージャPKGをコマンドラインから使用することができます(バージョン10.x以前は、古いpkg_*ツールが使われていました)。
  • 多くのLinuxディストリビューションと比べてユニークな、FreeBSDのFreeBSD Portsを使用することができます。FreeBSD Portsがインストールされていれば、/usr/portsに展開されます。このディレクトリは、自動的にアプリケーションをビルドすることができるMakefile(レシピのようなものです)を含んでいます。このディレクトリには、非常に多くのアプリケーションが含まれています。このシステムはメニューをつかってコンパイルオプションを変更することができ、簡単であるにもかかわらず、柔軟なソフトウェアのインストールを可能にします。